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Variabilidad genética de begomovirus en soya y malezas en Sinaloa

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dc.contributor.author Ruelas Ayala, Rey David
dc.date.accessioned 2009-08-05T18:47:18Z
dc.date.available 2009-08-05T18:47:18Z
dc.date.created 2007-12
dc.date.issued 2009-08-05T18:47:18Z
dc.identifier.citation Ruelas Ayala, Rey David. (2007). Variabilidad genética de begomovirus en soya y malezas en Sinaloa (Maestría en Recursos Naturales y Medio Ambiente). Instituto Politécnico Nacional, Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional, Unidad Sinaloa, México. es
dc.identifier.uri http://tesis.ipn.mx/handle/123456789/4164
dc.description Tesis (Maestría en Recursos Naturales y Medio Ambiente), Instituto Politécnico Nacional, CIIDIR, Unidad Sinaloa, 2007, 1 archivo PDF, (110 páginas). tesis.ipn.mx es
dc.description.abstract RESUMEN: La soya constituye uno de los diez cultivos de mayor importancia en el mundo. En Sinaloa representa la opción de rotación más importante en el verano. Sin embargo a partir de 1996 la superficie cultivada disminuyo drásticamente debido principalmente a enfermedades relacionadas con begomovirus. En la presente investigación se caracterizó y analizó la variabilidad genética de los begomovirus que afectan al cultivo de la soya en el valle de Guasave. Muestras de plantas de soya y malezas que presentaban síntomas típicos de begomovirus fueron colectadas en Sinaloa durante el 2004 y el 2005. El análisis por PCR mostró la presencia de begomovirus en 58 de las 69 plantas de soya colectadas y en todas las malezas analizadas. Todas las muestras que mostraron la presencia de begomovirus fueron analizadas por PCR-RFLP con las enzimas Msp I y Hha I. El análisis PCR-RFLP indico un alto grado de variabilidad genética entre los begomovirus que infectan soya y malezas en Sinaloa. Una comparación de los patrones de restricción generados en las muestras analizadas con patrones de restricción generados virtualmente con begomovirus previamente reportados permitió identificar al CdTV, al RhGMV de Honduras y al RhGMV de Sinaloa; este último resultó ser el begomovirus mas predominante y mostró ser infectivo en plantas de soya generando síntomas similares a los observados en campo en el experimento de biobalística. Por otro lado, se considera que las malezas juegan un papel clave en la dispersión de los begomovirus. En este trabajo se analizaron 11 muestras de malezas que corresponden a especies de Rhynchosia minima, Sida sp. y Malva sp. El análisis PCR-RFLP y de secuencia indicó la presencia del RhGMV Sinaloa en R. minima, el SiMSV en Sida sp. y un nuevo begomovirus en malva. Clones completos del SiMSV fueron generados por PCR y el análisis filogenético de sus genes mostró una cercana relación con el CdTV. Sin embargo, el análisis de la región intergénica mostró la más alta relación con el ToMoTV. Los iterones resultaron ser idénticos a los del PYMV y el ToMoTV. Estos resultados sugieren que el SiMSV pudiera formar pseudorecombinantes viables con el PYMV y ToMoTV. es
dc.description.abstract ABSTRAC: Soybean constitutes in importante one of the top ten worlwide crops. In Sinaloa it represents a good rotation-crop option during summer season. Nevertheless, since 1996 the crop surface has drastically reduced mainly due to problems with begomoviruses. The present work characterized and analized gentic variability of begomoviruses that affect soybean in Guasave valley. Samples from soybean and herb plants that presented the typical symptoms of begomovirus infection were collected in Sinaloa during 2004 and 2005. PCR analysis showed the presence of begomoviruses in 58 out of 69 soybean plants collected and in all herbaceous species analyzed. All samples showing begomovirus presence were analyzed by PCR-RFLP with the enzymes Msp I and Hha I. PCR-RFLP analysis indicated a high degree of genetic variability between begomoviruses infecting herbs and soybean in Sinaloa. A virtualgenerated band restriction pattern comparison between the collected samples and previously reported viruses allowed identification of CdTV, and RhGMV from Honduras and Sinaloa. This last one turned out to be the most predominant begomovirus and it showed to be infective in soybean plants producing similar field symptoms. On the other hand, herbs play a key role in dispersion of begomoviruses. In this work 11 samples from herbs were analyzed corresponding to the plant species Rhinchosia, Sida and Malva. PCRRFLP and sequence analysis indicated the presence of RhGMV Sinaloa in Rhinchosia minima, SiMSV in Sida sp., and a new begomovirus in Malva. Full length clones of SiMSV were PCR generated and phylogenetic analysis of its gene components show a close relationship to CdTV. Nevertheless, intergenic region analysis revealed a higher relationship to ToMoTV. Iterons were identical to the ones from PYMV and ToMoTV. These results suggest that SiMSV could form viable pseudo-recombinants with PYMV and ToMoTV. en
dc.language.iso es es
dc.subject Genetic variability en
dc.subject Soy en
dc.subject Undergrowth en
dc.subject Variabilidad genética es
dc.subject Soya es
dc.subject Maleza es
dc.title Variabilidad genética de begomovirus en soya y malezas en Sinaloa es
dc.type Thesis es
dc.contributor.advisor Méndez Lozano, Jesús


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