Caracterización y Filogenia de la Región Control del Genoma Mitocondrial de Especies del Género Ictalurus (Pisces: Ictaluridae) en el Noroeste de México

Abstract

El género Ictalurus es el único miembro de la familia Ictaluridae registrado en México, cuenta con especies muy utilizadas en la acuacultura, pesca deportiva y comercial (I. furcatus e I. punctatus) y con especies enlistadas dentro la Norma Oficial Mexicana (NOM-059-SEMARNAT-2001). El bagre Yaqui (I. pricei) se encuentra en la categoría de protección especial debido al impacto de las actividades productivas de la región. La introducción de bagres exóticos como I. punctatus e I. furcatus a las cuencas hidrólogicas donde el bagre Yaqui habita, ha ocasionado la reducción de su abundancia y distribución, ademas de promover su hibridación. La región control es la más variable del genoma mitocondrial, ya que presenta secuencias muy conservadas entre los vertebrados como las secuencias asociadas a la terminación de su replicación (TAS) y bloques de secuencias conservadas (CSB), además de secuencias hipervariables, que están involucradas en la replicación y transcripción mitocondrial. Debido a la heterogeneidad de sus secuencias, esta región ha sido utilizada para estudiar problemas filogenéticos diferenciando genéticamente a grupos estrechamente relacionados a nivel de especie e individuos. El objetivo de esta investigación es caracterizar la estructura de la región control y utilizarla para evaluar las relaciones filogenéticas de los bagres Ictalurus pricei, I. cf. pricei (río Batopilas), I. cf. pricei (río Tutuaca) e I. furcatus. El DNA fue obtenido de tejido de la aleta pélvica y para la amplificación de la región control se diseñaron oligonucleotidos de regiones que la flanquean. La construcción y análisis de secuencias de la región control se realizó utilizando los programas de cómputo DNAStar y BIOEDIT. El análisis filogenético se desarrolló con el programa PAUP utilizando los criterios de distancias, máxima parsimonia y máxima verosimilitud con un bootstrap de 1000 replicas. Se logró obtener y caracterizar la región control completa de dos ejemplares de I. pricei, un ejemplar de I. cf. pricei (Batopilas), I. cf. pricei (Tutuaca) e I. furcatus. Se identificaron tres repeticiones TACAT y 2 repeticiones de ATGTA identificándose como secuencias asociadas a la terminación de la síntesis de la cadena pesada llamadas TAS. Se localizaron tres CSB y un dominio central. Los CSB2 y CSB3 fueron los más conservados entre los Ictalurus y el más variable fue el CSB1. Las bases más abundantes fueron la adenina (A) y la timina (T) y la menos abundante fue la guanina (G). La inferencia filogenética basada en distancias genéticas, xiii máxima parsimonia y máxima verosimilitud permitió identificar un grupo monofilético de bagres nativos para el Noroeste de México (I. pricei, I. cf. pricei del río Tutuaca, e I. cf. pricei del río Batopilas) definiendo la identidad especifica del bagre Yaqui y del género Ictalurus. La región control proporcionó una inferencia filogenética congruente con la información existente sobre la evolución del género y elevó el nivel de confidencia en el análisis de máxima verosimilitud.